新版GMP文件編寫文件目錄的分類依據：
制藥企業文件目錄的編排形式，可以從文件不同的類型上進行基本文件的編排，也可以從GMP基本要素上進行系列編排；有的制藥企業按SMP和SOP目錄編排，有的制藥企業按不同的部門和工序進行編排，形式可以是多種多樣的，因為GMP沒有明確規定，也沒有強求文件目錄的格式。新版GMP文件編寫GMP強調的是GMP文件的適用性和科學性。新版GMP文件編寫文件總目錄的編制是綱，綱舉才能目張。其適用性是為質量體系要素和GMP所要求，其科學性是按一定的規律，如編碼規則等進行的。新版GMP文件編寫但是在GMP文件總目錄的劃分上要注意以下幾點問題：
其一，在GMP認證檢查時，是按GMP各章節的內容來劃分檢查項目的。
其二，檢查人員在檢查過程的分工負責上，也是按GMP各章節的內容來劃分的。
其三，GMP認證申報材料中要求企業提供的文件目錄也是按GMP規范的章節來劃分的。
因此，建議企業從開始劃分新版GMP文件編寫目錄時就按GMP規范的章節來劃分的。
新版GMP文件編寫廣東省包裝技術協會塑料包裝專業委員會是一家專門從事食品/藥品/化妝品/包裝/保健品/醫療器械/等GMP認證咨詢、輔導、注冊報批及潔凈車間裝修(萬級/10萬級/三十萬級)改造和提供《企業標準》備案咨詢、ISO（國際標準化組織）標準培訓、企業現場管理培訓、驗廠輔導、等服務的專業咨詢機構。
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