水由進水口進入自清洗過濾器，首先經過粗濾芯組件濾掉較大顆粒的雜質，然后到達細濾網，通過細濾網濾除細小顆粒的雜質后，清水由出水口排出。在自清洗過濾器過濾過程中，細濾網的內層雜質逐漸堆積，自清洗過濾器的內外兩側就形成了一個壓差。當自清洗過濾器壓差達到預設值時，將開始自動清洗過程：排污閥打開，主管組件的水力馬達室和水力缸釋放壓力并將水排出；水力馬達室及吸污管內的壓力大幅下降，由于自清洗過濾器負壓作用，通過吸嘴吸取細濾網內壁的污物，由水自清洗過濾器力馬達流入水力馬達室，由排污閥排出，形成一個吸污過程。當自清洗過濾器水流經水力馬達時，帶動吸污管進行旋轉，由水力缸活塞帶動吸污管作軸向運動，吸污器組件通過軸向運動與旋轉運動的結合將整個濾網內表面完全清洗干凈。整個清洗過程將持續數十秒。排污閥在清洗結束時關閉，增加的水壓會使水力缸活塞回到其初始位置，自清洗過濾器開始準備下一個沖洗周期。在清洗過程中，過濾機正常的過濾工作不間斷。