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廣州貫善生物科技有限公司

主營(yíng):高通量測(cè)序,蛋白質(zhì)組學(xué),分子生物學(xué)
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[供應(yīng)]宏基因組測(cè)序
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  • 產(chǎn)品產(chǎn)地:廣東廣州
  • 產(chǎn)品品牌:貫善生物
  • 包裝規(guī)格:SATXAM2016
  • 產(chǎn)品數(shù)量:1000000
  • 計(jì)量單位:個(gè)
  • 產(chǎn)品單價(jià):9000
  • 更新日期:2016-06-13 08:53:42
  • 有效期至:2017-06-13
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宏基因組測(cè)序 詳細(xì)信息

宏基因組測(cè)序

 

    宏基因組測(cè)序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進(jìn)行提取和高通量測(cè)序,分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測(cè)序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息,分析微生物群體基因組及功能,也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系,發(fā)掘和研究新的功能基因。

 

    一、技術(shù)流程

 

    二、生物信息分析內(nèi)容

        1. 測(cè)序質(zhì)量分析與統(tǒng)計(jì)、評(píng)估

        2.數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì);

        3. 物種豐度分析;

        4. 功能基因注釋;

        5. 基因功能豐度差異分析;

        6. Pathway富集分析;

        7.豐度差異基因/物種聚類分析

        8. PCA分析

 

    三、結(jié)果展示

        1.數(shù)據(jù)庫(kù)使用

數(shù)據(jù)庫(kù)

網(wǎng)頁(yè)鏈接

NCBI NR

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db

KEGG Pathway

kegg.jp

 

        2.版圖展示

        

        圖1.1所示,PCA分析有效展示樣本間的關(guān)系

圖1.1 PCA

 

    四、樣本要求

        總量:〉5 μg gDNA;濃度:〉100 ng/μL;260/280:〉1.8

 

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