一、定義上的區別
1、轉廠的定義：深加工結轉（轉廠）指的是在中國內地由合資企業或者外資加工企業生產加工的出口用產品，轉向另一個在內地的合資企業或者外資加工企業進行組裝、加工。從商品流通來看，‘轉廠’在國內進行，屬于國內交易。但是，因為生產加工的產品是出口產品，而且交易雙方大多是外資或者合資企業，結算都是在境外用外匯進行，所以‘轉廠’被視為是加工貿易的一環。
2、保稅區轉廠：國內的一般貿易的企業（包括有進出口權或沒有進出口權的）如果希望把產品轉廠給加工貿易企業（來料加工或進料加工企業），那么你就需要用到——保稅區轉廠。
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二、流程的區別1、深加工結轉流程：      
 備案（電子申請表備案/紙質申請表備案）——→報關——→ 付款
2、保稅區轉廠的流程：1）國內沒有進出口權的企業通過買單出口到保稅區(兜圈退稅)/物流園（進園稅），然后國內的加工貿易型企業利用手冊（清關/轉關）進口；2）國內一般貿易企業一般貿易出口到保稅區(兜圈退稅)/物流園（進園稅），然后國內的加工貿易型企業利用手冊（清關/轉關）進口；3）國內加工貿易企業手冊出口核銷到保稅區(兜圈退稅)/物流園（進園稅），然后國內的加工貿易型企業利用手冊（清關/轉關）進口；


三、加工貿易型企業利用保稅區轉廠的好處1、 加工貿易企業利用保稅區轉廠可以達到退稅目的（如果做直接轉廠，企業不能夠向稅務局申請出口退稅）2、 可以解決報關資料不附（雙方商品編碼不相同）的問題；3、效率快：進出福保以及手續辦理只需半天的時間。 更多進出口報關清關問題請直接致電：13798333917QQ：100380083梁先生