電子式水處理器是利用電子元器件產生的高頻交變電磁場，讓水在經過水處理器時，物理性能發生改變——原來締合鏈狀大分子斷裂成單個水分子，水分子的偶極矩增大，帶有極性的單個水分子包圍在水中溶解鹽的正負離子周圍，使鹽離子運動速度降低，靜電引力下降，碰撞結合的機會大大減少，無法形成水垢，達到防垢的目的。極性水分子的偶極矩增大，與鹽正負離子的吸引力增大，從而使受熱面或管壁原有的水垢變得松軟，龜裂，在水中力的作用下，以致自行脫落，從而達到除垢的目的，同時水中微電流破壞微生物的生存環境，另外在水中形成的活性氧自由基能氧化微生物的細胞膜，破壞微生物的歧化酶，從而殺滅水中的微生物，達到殺菌滅藻的目的。