微耕機在使用前機農一定要進行培訓，而培訓有兩個方面，一個是操作保養技術培訓，二是為農服務經營技巧培訓。諸如柴油機的使用、旋耕刀具的選用、田間轉移、耕作技巧、維護保養等都有許多可以學習的地方。培訓得好，機手操作技術越好，保養得好，機器的性能就越好，其節油性也好，作業質量也好，經濟收益也就越好。

 田間轉移時如果不小心會導致微耕機側翻，碰到這種情況要立即停機，若因操作機構損壞導致發動機不能停機的，可立即按減壓手柄停車（這種方法只允許在發動機不能正常停機或柴油機飛車等緊急情況下使用）；機器有小故障時要盡快處理，否則“小病不醫，終成大患”。注意：在清理旋耕刀具上纏繞的雜草或處理其它小故障時，一定要先停機后實施；冬天氣溫低柴油機不好起動時，可更換符合牌號的粘度較小的機油，嚴禁用進氣點火的方式起動。 微耕機使用季節性強，農閑期停放往往長達半年以上，若停放方法不當，也會損壞（比如：氣門關閉不嚴會造成氣門和缸套生銹等）。需要長期停放的微耕機，在最后一次用完后，要趁熱排出柴油機內的舊機油，注入新機油，拆下氣缸蓋罩上的加油螺塞，加入大約2毫升機油，按下減壓起動手柄不要松開，拉動反沖起動拉繩5-6次（一般不需要起動柴油機），然后松開減壓手柄，慢慢拉動起動拉繩，直至感覺有較大阻力為止。放掉柴油機油箱中的柴油（可留少許）。接著放出變速行走箱中的機油，注入新的機油，最后清除微耕機及刀具上的機油、泥土、雜草等，把機器存放在通風干燥和不被日曬雨淋的地方。