一.Pulldown的概念
       在Pulldown實驗中,帶標簽的誘餌蛋白能被特異結合該標簽的固相親和配基捕獲,形成“次級親和支持物”,用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產物洗脫后,經Westernblot驗證或LC-MS/MS,即可證明或鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。
二.Pulldown實驗流程
                                                                          圖1.Pulldown流程示意圖
三.Pulldown實驗方案設計
1、構建含His或GST標簽的誘餌蛋白原核表達載體;
2、原核表達誘餌蛋白(我們采用自誘導培養基培養細菌,能有效降低包涵體的形成);
3、細菌裂解液過柱,帶標簽的誘餌蛋白被固相化親和配基捕獲,產生“次級親和支持物”;
4、待測樣品裂解液過柱孵育,與誘餌蛋白互作的蛋白被“次級親和支持物”吸附;
5、清洗,離心,去除未結合的雜蛋白;
6、洗脫,得到誘餌蛋白及其互作蛋白的復合物;
7、如要驗證某蛋白X與誘餌蛋白互作,則將6.所得的蛋白復合物與X蛋白的抗體孵育,做Westernblot驗證即可;
8、如要尋找誘餌蛋白可能的互作蛋白,則需將6.所得的蛋白復合物做LC-MS/MS鑒定;
圖2.Pulldown實驗流程圖
四.生物信息學分析GO注釋統計
 
                                                    
 Pathway分析
五.Pulldown實驗技術服務內容
1、原核表達載體構建;
2、融合蛋白的誘導表達與純化;
3、pulldown捕獲互作蛋白;
4、Westernblot驗證或LC-MS/MS鑒定互作蛋白;
5、數據檢索、生物信息學分析;
6、結果分析與報告整理。