新版GMP自2011年3月起，凡新建藥品生產企業、藥品生產企業新建（改、擴建）車間均應符合新版藥品GMP的要求。現有藥品生產企業血液制品、疫苗、注射劑等無菌藥品的生產，應在2013年12月31日前達到新版藥品GMP要求。新版GMP其他類別藥品的生產均應在2015年12月31日前達到新版藥品GMP要求。未達到新版藥品GMP要求的企業（車間），在上述規定期限后不得繼續生產藥品。 
新版GMP現有《藥品GMP證書》有效期滿但尚未達到新版藥品GMP要求的，藥品生產企業應在原《藥品GMP證書》期滿前六個月，按照《藥品生產質量管理規范（1998年修訂）》要求進行自查，并將自查結果報送所在地省級藥品監督管理部門。省級藥品監督管理部門應對企業自查情況開展監督檢查。新版GMP符合要求的，血液制品、疫苗、注射劑等無菌藥品生產企業現有《藥品GMP證書》有效期延續至2013年12月31日；其他類別藥品現有《藥品GMP證書》有效期延續至2015年12月31日。新版GMP不符合要求的，由省級藥品監督管理部門監督企業進行整改，整改期間收回《藥品GMP證書》。國家局將在網站上對藥品生產企業《藥品GMP證書》延續情況予以公示。
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